Setelah menghabiskan belasan tahun hidupnya sebagai pelarian politik di banyak negara, pada tahun 1942, semasa penjahahan Jepang, Tan Malaka, kembali Indonesia, dan terlibat dalam berbagai upaya mendorong para pemuda, dan para tokoh Republik untuk segera memproklamirkan kemerdekaan Indonesia.
Namun, setelah kemerdekaan diproklamirkan, dan Republik Indonesia berdiri, Tan Malaka yang konsisten memperjuangkan "kemerdekaan seratus persen" untuk Indonesia, harus berhadapan dengan realitas politik, hingga terlibat konflik politik dengan para tokoh Republik lainnya.
Karena pemikiran dan prinsip anti penjajahannya yang konsisten, pada tahun 1946-1948, Tan Malaka bahkan sempat dipenjara oleh pemerintahan RI, sebelum akhirnya ditembak mati, juga oleh tentara dari bangsanya sendiri beberapa bulan setelah dibebaskan dari penjara.
