В конце 1970-х ученые научились картировать полиморфизмы, приводящие к изменению сайтов рестрикции. Это позволило изучать менделевские заболевания, которые в первом приближении вызываются единственной мутацией и успешно анализируются по родословным. Но для анализа сложных признаков разрешение метода было недостаточным. Это стало ясно в 90е годы XX века.
