Misiunea Institutului este organizarea şi efectuarea investigaţiilor ştiinţifice fundamentale şi cu caracter aplicativ în domeniul patrimoniului arheologic, etno-cultural şi artistic al Republicii Moldova, având ca sarcină majoră dezvoltarea durabilă a ţării în baza rezultatelor activităţii de cercetare-dezvoltare, la promovarea şi implementarea valorilor ştiinţifice şi culturale, obţinute în plan naţional şi internaţional.
