Para estudar as propriedades de um microrganismo e proceder a sua identificação, é necessário isolá-lo em cultura pura (axênica), ou seja, uma cultura isenta de todos os demais tipos de organismos, onde todas as células na população sejam idênticas (originárias de uma mesma célula parental).
Para o isolamento de microrganismo é necessária uma sequência de transferências de meios de cultivo até obter cultura pura. Essa transferência é denominada repicagem e poderá ser feita para tubos, ou outros recipientes contendo meio líquido ou sólido em função dos objetivos do trabalho.
A porção da colônia que será transferida chama-se inóculo e a operação deverá ser feita com todos os cuidados de assepsia, a fim de evitar contaminações, garantindo, assim, a qualidade do trabalho.
O isolamento consiste na obtenção de culturas puras que envolvem somente o organismo de interesse. Na fase do isolamento, ocorre a seleção de uma colônia através da observação da produção de determinado produto ou da morfologia da colônia. Nas placas que utilizamos, entretanto, não temos certeza de que apenas uma espécie de microrganismo existe em cada UFC (Unidade Formadora de Colônia). Portanto, precisamos utilizar a técnica de semeadura por estrias para isolar completamente apenas um microrganismo. Essa técnica também é chamada de esgotamento de alça. Existem várias possibilidades de fazer essas estrias, sendo ela descontínua ou contínua.
Na forma contínua com estrias simples, haveria primeiramente a coleta de uma pequena quantidade de células bacterianas e as estrias seriam iniciadas em uma das bordas da placa, percorrendo a alça até a outra borda da placa.
Na forma contínua com estrias compostas, a alça é percorrida somente de uma borda até o centro da placa. Do lado oposto, na outra metade da placa, o mesmo procedimento é repetido. As colônias isoladas estarão mais ao centro e, através da repetição, poder-se-ia obter microrganismos que estavam presentes na segunda amostra da colônia, porém não presentes na primeira.
Mesmo após a obtenção de cultura pura (axênica), esta precisa ser mantida em meio adequado ou, dependendo da finalidade, multiplicada para a obtenção de maior quantidade de células ou de biomassa. Em qualquer dos casos, o microrganismo precisa ser transferido periodicamente para meio de cultura novo, de mesma composição ou de composição diferente, dependendo do trabalho a ser executado.
