El ENEP cuenta con el apoyo de la Agencia de los Estados Unidos para el Desarrollo Internacional (USAID) y geAm -- Gestión Ambiental, a través del Programa de Democracia "Calidad en la Gestión Pública". Igualmente cooperan con la iniciativa, la organización Semillas para la Democracia, Agencia Española de Cooperación Internacional para el Desarrollo (AECID); el Programa de las Naciones Unidas para el Desarrollo en Paraguay (PNUD) y del Parque Tecnológico Itaipu.
