Las malformaciones congénitas también es algo que en la unidad que forma el Dr. Walter Plasencia intentan diagnosticar desde el inicio de la gestación. Realizan un cribado de malformaciones en el primer trimestre, entre la semana 11- 14 y un cribado de malformaciones también alrededor de la semana 20 - 22.

En el primer trimestre, lo que intentan es predecir o diagnosticar aquellas malformaciones fetales graves que se pueden desarrollar en el embarazo. Son estudios exhaustivos que realizan al inicio de la gestación en el momento en el cual se realiza el cribado de anomalías cromosómicas.

Complementan este estudio del primer trimestre con un estudio detallado alrededor de la semana 20-22 aquellas malformaciones que no se podrían diagnosticar en el primer trimestre, como pueden ser las malformaciones a nivel cerebral.

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