O curso de Engenharia Química da Unochapecó busca preparar profissionais capazes de desempenhar atividades dentro das diversas indústrias de processos químicos e integrar grupos de pesquisadores, desenvolvendo projetos e processos produtivos, objetivando a otimização dos recursos e sustentabilidade de processos. Conta com a Empresa Júnior como uma forma de capacitação dos acadêmicos que já vivenciam a prática, além de desenvolver projetos de pesquisa que envolvem diversos alunos e estão voltados à área de nanotecnologia, biocombustíveis, tratamento de efluentes e polímeros. O curso possui um qualificado corpo docente composto por sete doutores e oito mestres.

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