San Juan de Sabinas se encuentra ubicado en la región carbonífera, hacia el norte del estado de Coahuila, en una extensión territorial de 735.4 km cuadrados, el municipio se localiza a 380 metros sobre el nivel del mar, y a 135 km al sur de la ciudad fronteriza de Piedras Negras ubicada en la Frontera entre Estados Unidos y México y a 328 km al norte de la ciudad capital del estado, Saltillo.
Sus límites territoriales son al norte y al oeste con el municipio de Múzquiz y al sur y este con el municipio de Sabinas.
El clima es seco semicálido, sobre San Juan de Sabinas cruza la carretera federal 57 México-Piedras Negras y la estatal 93 Palau-Múzquiz.
