Siguatepeque está situado al norte de la Reserva biológica de Montecillos, en la meseta central de Honduras, en la región central, entre las dos principales ciudades, como son: Tegucigalpa y San Pedro Sula. Distando a 114 kilómetros de la primera y 139 kilómetros de la segunda.
Está situado en una meseta altiplanicie, rodeada de verdes pinares que aún oxigenan la ciudad, formando parte del departamento de Comayagua, levantándose entre 1000 y 1200 m s. n. m. Su ubicación es de 14° 36′ 0″ de latitud norte y 87° 49′ 60″ de longitud oeste, teniendo su municipio una extensión territorial de 392.2 km².
